El Consejo Académico tiene como principal objetivo planificar y establecer los lineamientos principales para el buen funcionamiento del COES, sus líneas y agendas de investigación, Observatorios y encuesta ELSOC, así como el cumplimiento de los objetivos y metas establecidas. El Consejo incluye a los/as Investigadores/as Principales de las cuatro líneas de investigación del Centro, así como representantes en equilibrio de las cuatro universidades patrocinantes y los diversos estamentos del COES.